Маркировка лекарств состоит из двух обязанностей. Производитель наносит средство идентификации на упаковку по ч. 4 ст. 67 Закона № 61-ФЗ, а юридические лица и индивидуальные предприниматели, которые производят, хранят, ввозят, отпускают, продают, передают, применяют или уничтожают препарат, обеспечивают внесение информации о нём в систему мониторинга по ч. 7 ст. 67 Закона № 61-ФЗ. Состав сведений зависит от вида деятельности и установлен Правительством.
Средство идентификации ставится на вторичную (потребительскую) упаковку, а на первичную — когда вторичная не предусмотрена. Для препаратов с наименованием «Этанол» по ч. 4 ст. 67 Закона № 61-ФЗ средство идентификации наносится на первичную упаковку, если вторичной нет или в ней больше одной единицы препарата.
Маркировке не подлежат препараты для клинических исследований и экспорта, радиофармацевтические, отдельные высокотехнологичные препараты малых серий для конкретного пациента, пиявки и газы медицинские, а также препараты, которые ч. 4 ст. 67 Закона № 61-ФЗ называет отсылкой к другой статье закона; перечень исключений закрытый. Характеристики средства идентификации и порядок нанесения определяет Правительство по ч. 5 ст. 67 Закона № 61-ФЗ.
Информация в системе — ограниченного доступа по ч. 9 ст. 67 Закона № 61-ФЗ, за исключением информации, недопустимость ограничения доступа к которой установлена федеральными законами, и информации, отнесённой Правительством к общедоступной. Компания видит свои операции и общедоступные сведения по ч. 9.4 ст. 67 Закона № 61-ФЗ.