Какие налоги платят медицинские организации
Налоговая нагрузка клиники складывается с учётом её режима, доходов и недвижимости. Для медицинской деятельности предусмотрена нулевая ставка по прибыли при соблюдении условий, а освобождение от НДС связано с конкретными операциями.

Коротко
Это зависит от вида операций и налогового режима: медицинские организации учитывают налог на прибыль, НДС и налог на имущество с применимыми льготами. По прибыли возможна ставка 0 процентов при выполнении условий. При упрощённой системе предусмотрено освобождение от налога на прибыль и имущество; иные налоги и страховые взносы сохраняются.
Ответ подробно: налоги медицинской организации по видам
Чтобы определить, какие налоги платит медицинская организация, начните с её режима налогообложения. При упрощённой системе действует освобождение от налога на прибыль организаций и налога на имущество организаций. При этом клиника продолжает платить иные налоги, сборы и страховые взносы и выполнять обязанности налогового агента — ст. 346.11 НК РФ.
Если речь о налоге на прибыль, медицинская деятельность позволяет применять ставку 0 процентов. Для этого нужны лицензия, деятельность из правительственного перечня и выполнение условий по доходам и штату. Доля соответствующих доходов должна составлять не менее 90 процентов; предусмотрен также случай отсутствия учитываемых доходов. Непрерывно требуются не менее 15 работников и не менее 50 процентов медицинского персонала с сертификатом или аккредитацией. Операции с векселями и производными финансовыми инструментами исключены — ст. 284.1 НК РФ.
Для перехода на нулевую ставку подайте в налоговый орган по месту нахождения заявление и сведения о лицензии не позднее чем за один месяц до начала налогового периода. После его окончания подтверждайте долю доходов и численность персонала. Нарушение условий ведёт к восстановлению налога и пеням — ст. 284.1 НК РФ.
По НДС сопоставляйте каждую операцию с условиями освобождения. Например, льгота касается продуктов питания, которые столовая медицинской организации непосредственно изготовила и реализовала в этой организации. Для лицензируемой деятельности требуется соответствующая лицензия — ст. 149 НК РФ.
По налогу на имущество оцените недвижимость клиники: значение имеют права на объект, его учёт и способ определения налоговой базы. Земельные участки объектом именно этого налога не признаются. Критерии для недвижимости закреплены в ст. 374 НК РФ ч.2; освобождение при упрощённой системе предусмотрено ст. 346.11 НК РФ.
Что говорит закон: налоги медицинской организации на упрощённой системе
Статья в редакции Федерального закона от 28.11.2025 № 425-ФЗ. Текст — из базы законов «ВРУЦКИЙ ПРАВО».
Что говорит закон: нулевая ставка для медицинской деятельности
Статья в редакции Федерального закона от 29.11.2021 № 383-ФЗ. Текст — из базы законов «ВРУЦКИЙ ПРАВО».
Документы: подтверждение налоговых льгот медицинской организации
Для нулевой ставки по прибыли медицинской организации подготовьте сведения о лицензии, доходах и составе персонала.
| Документ |
|---|
| Заявление о применении ставки 0 процентов по налогу на прибыль |
| Сведения о дате предоставления и регистрационном номере лицензии на медицинскую деятельность |
| Сведения о доле доходов от деятельности, учитываемой для нулевой ставки |
| Сведения о численности работников в штате медицинской организации |
| Сведения о численности медицинского персонала с сертификатом специалиста или свидетельством об аккредитации |
Частые вопросы: льготы по налогам медицинских организаций
Вопросы о лицензии, персонале и налоговых обязанностях медицинской организации при разных режимах.
Достаточно ли медицинской лицензии для нулевой ставки по прибыли?
Нет, наряду с лицензией клинике нужно выполнить требования к деятельности, доле доходов и численности работников. Отдельное условие касается доли медицинского персонала с сертификатом или аккредитацией. Запрет на операции с векселями и производными финансовыми инструментами также входит в условия ст. 284.1 НК РФ.
Сохраняются ли страховые взносы у клиники на упрощённой системе?
Да, упрощённая система сохраняет уплату страховых взносов в соответствии с законодательством о налогах и сборах. Клиника также исполняет обязанности налогового агента: освобождение от налога на прибыль организаций эти обязанности не отменяет — ст. 346.11 НК РФ.
Подходит ли санаторно-курортное лечение для нулевой ставки по прибыли?
Для применения этой льготы санаторно-курортное лечение к медицинской деятельности не относится. Статья 284.1 НК РФ связывает медицинскую деятельность с правительственным перечнем и прямо выделяет санаторно-курортное лечение из этой категории. Учитывайте это при определении права организации на ставку 0 процентов.
Услуги и темы рядом
Смежные темы о налоговых режимах и льготах для медицинской организации.
Не откладывайте защиту