Как меняются сроки проверки после подачи уточнённой декларации

Если вы подали уточнённую декларацию, пока налоговый орган ещё проверяет первоначальную, ожидание окончания прежнего срока теряет практический смысл. Вместо проверки первоначальных показателей начинается проверка исправленных. Остаток времени по прежней декларации к новой проверке не переносится. Для обычной декларации отсчитывайте три месяца со дня представления уточнения: это следует из сочетания п. 2 и 9.1 ст. 88 НК РФ.

Условие для такого перехода — уточнение поступило до окончания камеральной проверки. Сопоставьте дату его представления с ходом проверки первоначальной декларации. Правило о прекращении прежней и начале новой проверки относится именно к этой ситуации. Если исправления подаются во время уже начатой проверки уточнения, основанием следующей проверки становится вновь представленная уточнённая декларация. Порядок смены проверяемой декларации закреплён в п. 9.1 ст. 88 НК РФ.

Для декларации по НДС ориентир другой: камеральная проверка длится два месяца со дня её представления. Если до завершения проверки налоговый орган обнаружит признаки возможного нарушения, руководитель или его заместитель вправе продлить её до трёх месяцев. Это общий срок от подачи декларации, а не ещё три месяца после первоначальных двух. Для иностранного лица, состоящего на специальном учёте, предусмотрен срок шесть месяцев — п. 2 ст. 88 НК РФ.

Отдельно учитывайте уведомление о признании декларации непредставленной. Проверка этой декларации прекращается в день направления уведомления. Если непредставленной признали именно уточнённую декларацию, налоговый орган возобновляет проверку предшествующей. В её срок не засчитывается время, потраченное на прекращённую проверку уточнения. Здесь прежний срок продолжается с исключением этого промежутка, а не начинается заново — п. 9.1 ст. 88 НК РФ.

Смена декларации не обнуляет уже собранные сведения. Действия по проверке прежней декларации прекращаются, однако полученные документы и сведения налоговый орган может использовать при налоговом контроле. Поэтому при подготовке пояснений учитывайте материалы, которые уже представляли: исправленные показатели могут сопоставляться с ними. Такой порядок обращения с ранее полученными материалами установлен п. 9.1 ст. 88 НК РФ.

Если уточнение подано по истечении двух лет со дня установленного срока подачи декларации и уменьшает налог к уплате либо увеличивает убыток, подготовьте подтверждение изменений. Налоговый орган вправе запросить первичные и иные документы, а также аналитические регистры налогового учёта с показателями до исправления и после него. Именно сочетание времени подачи и содержания исправлений даёт такое право по п. 8.3 ст. 88 НК РФ.

При получении требования документов соотнесите его с основанием запроса. Общее правило ограничивает истребование дополнительных сведений и документов случаями, предусмотренными законом, включая обязанность представить документы вместе с декларацией. Для позднего уточнения с уменьшением налога действует указанное специальное основание. Эти правила содержатся в п. 7 и 8.3 ст. 88 НК РФ.